Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms