Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CDRT15Q96T59 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CDRT15Q96T59 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CDRT15Q96T59 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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CDRT15Q96T59 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CDRT15Q96T59 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CDRT15Q96T59 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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