Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRBNQ96SW2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRBNQ96SW2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms