Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCT8L2Q96SF2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms