Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms