Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDC1Q96MU7 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms