Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOLD1Q96LR9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms