Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPTM1LQ96KA5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.2 ms