Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLDN23Q96B33 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms