Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms