Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms