Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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PTPRUQ92729 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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PTPRUQ92729 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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PTPRUQ92729 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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PTPRUQ92729 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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PTPRUQ92729 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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PTPRUQ92729 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
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PTPRUQ92729 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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PTPRUQ92729 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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PTPRUQ92729 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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PTPRUQ92729 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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