Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC38A9Q8NBW4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms