Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS8Q8N3P4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS8Q8N3P4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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