Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms