Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED27Q6P2C8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms