Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms