Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXA9

SIRPB2, Signal-regulatory protein beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPB2Q5JXA9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRPB2Q5JXA9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRPB2Q5JXA9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRPB2Q5JXA9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRPB2Q5JXA9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRPB2Q5JXA9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRPB2Q5JXA9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SIRPB2Q5JXA9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SIRPB2Q5JXA9 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIRPB2Q5JXA9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms