Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms