Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KNOP1Q1ED39 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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