Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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