Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UPP1Q16831 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UPP1Q16831 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
UPP1Q16831 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UPP1Q16831 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UPP1Q16831 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
UPP1Q16831 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UPP1Q16831 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UPP1Q16831 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UPP1Q16831 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UPP1Q16831 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms