Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms