Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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