Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCSK7Q16549 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms