Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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VAMP3Q15836 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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VAMP3Q15836 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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VAMP3Q15836 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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VAMP3Q15836 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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VAMP3Q15836 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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VAMP3Q15836 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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VAMP3Q15836 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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