Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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SYCP1Q15431 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
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SYCP1Q15431 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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SYCP1Q15431 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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SYCP1Q15431 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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SYCP1Q15431 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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SYCP1Q15431 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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SYCP1Q15431 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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SYCP1Q15431 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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SYCP1Q15431 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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