Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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