Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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COL19A1Q14993 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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COL19A1Q14993 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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COL19A1Q14993 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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COL19A1Q14993 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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COL19A1Q14993 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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COL19A1Q14993 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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COL19A1Q14993 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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COL19A1Q14993 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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COL19A1Q14993 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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COL19A1Q14993 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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COL19A1Q14993 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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COL19A1Q14993 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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COL19A1Q14993 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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