Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIN2CQ14957 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIN2CQ14957 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms