Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
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CHD4Q14839 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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CHD4Q14839 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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CHD4Q14839 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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CHD4Q14839 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD4Q14839 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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CHD4Q14839 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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CHD4Q14839 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD4Q14839 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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