Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IHHQ14623 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IHHQ14623 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IHHQ14623 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IHHQ14623 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IHHQ14623 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IHHQ14623 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IHHQ14623 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IHHQ14623 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IHHQ14623 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IHHQ14623 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IHHQ14623 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IHHQ14623 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IHHQ14623 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IHHQ14623 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IHHQ14623 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IHHQ14623 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IHHQ14623 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IHHQ14623 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms