Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SEMA3AQ14563 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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