Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIDRQ14159 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms