Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGB1Q14028 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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