Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
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