Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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