Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PEX6Q13608 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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