Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 641.3 ms