Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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