Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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CHAF1AQ13111 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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CHAF1AQ13111 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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CHAF1AQ13111 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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CHAF1AQ13111 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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CHAF1AQ13111 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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CHAF1AQ13111 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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CHAF1AQ13111 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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CHAF1AQ13111 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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CHAF1AQ13111 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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