Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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IFT88Q13099 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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IFT88Q13099 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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