Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFX1Q12986 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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