Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms