Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms