Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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