Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FOXF1Q12946 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FOXF1Q12946 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FOXF1Q12946 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FOXF1Q12946 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXF1Q12946 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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