Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIAQ12857 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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