Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FOXO1Q12778 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FOXO1Q12778 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FOXO1Q12778 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FOXO1Q12778 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FOXO1Q12778 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FOXO1Q12778 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FOXO1Q12778 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FOXO1Q12778 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FOXO1Q12778 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FOXO1Q12778 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FOXO1Q12778 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FOXO1Q12778 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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