Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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